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  • makeChangeoClone: Generate a ChangeoClone object for lineage . . .
    Generate a ChangeoClone object for lineage construction Description makeChangeoClone takes a data frame with AIRR or Change-O style columns as input and masks gap positions, masks ragged ends, removes duplicate sequences, and merges annotations associated with duplicate sequences It returns a ChangeoClone object which serves as input for lineage reconstruction Note: To use the most recent
  • makeChangeoClone function - RDocumentation
    makeChangeoClone: Generate a ChangeoClone object for lineage construction Description makeChangeoClone takes a data frame with AIRR or Change-O style columns as input and masks gap positions, masks ragged ends, removes duplicate sequences, and merges annotations associated with duplicate sequences It returns a ChangeoClone object which serves as input for lineage reconstruction Note: To use
  • R: Generate a ChangeoClone object for lineage construction
    Generate a ChangeoClone object for lineage construction Description makeChangeoClone takes a data frame with AIRR or Change-O style columns as input and masks gap positions, masks ragged ends, removes duplicates sequences, and merges annotations associated with duplicate sequences It returns a ChangeoClone object which serves as input for lineage reconstruction Usage makeChangeoClone( data
  • Read the Docs
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  • alakazam: makeChangeoClone – R documentation – Quantargo
    Description makeChangeoClone takes a data frame with AIRR or Change-O style columns as input and masks gap positions, masks ragged ends, removes duplicates sequences, and merges annotations associated with duplicate sequences It returns a ChangeoClone object which serves as input for lineage reconstruction
  • Generate a ChangeoClone object for lineage construction
    Description makeChangeoClone takes a data frame with AIRR or Change-O style columns as input and masks gap positions, masks ragged ends, removes duplicates sequences, and merges annotations associated with duplicate sequences It returns a ChangeoClone object which serves as input for lineage reconstruction
  • GitHub - immcantation alakazam: Alakazam is part of the Immcantation . . .
    Alakazam is part of the Immcantation analysis framework for Adaptive Immune Receptor Repertoire sequencing (AIRR-seq) and provides a set of tools to investigate lymphocyte receptor clonal lineages,
  • 【免疫组库分析】Alakazam包【基因使用、多样性及氨基酸理化性质分析】使用说明-腾讯云开发者社区-腾讯云
    Alakazam是Immcantation框架中的R包,专注于免疫组库分析,提供克隆谱系重建、多样性分析、基因使用统计等功能。支持Change-O和AIRR格式数据输入,包含序列清洗、理化性质计算、克隆丰度评估等工具。通过CRAN或GitHub安装,适用于免疫球蛋白和TCR测序数据分析,帮助研究人员深入探索淋巴细胞受体




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